泛癌免疫分析也可以做的這樣簡單!( 二 )



泛癌免疫分析也可以做的這樣簡單!
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Fig.6
在分析中觀察到TIME因子和ICPs表現出共現性而不是互斥性 。 此外 , OS (Fig.7A)、無進展生存期(PFS) (Fig.7B)、DFS (Fig.7C)和疾病特異性生存期(DSS) (Fig.7D)的綜合預后分析表明 , TIME因子和ICPs的綜合基因組改變對胰腺癌患者的多個預后顯著不利 。

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Fig.7
04
ICPs、TIME因子、ICD介質和腫瘤免疫之間的關系
使用GEPIA進一步研究了胰腺癌中ICD介質、TIME因子、ICPs和effective T-cell signature之間的相關性 。 首先 , 確定了TIME因子與ICPs之間的顯著相關性(R=0.93 , P<0.01) (Fig.8A) , ICD介質和ICPs(R=0.92 , P<0.01) (Fig.8B) , 以及ICD介質和TIME因子(R=0.94 , P<0.01) (Fig.8C) 。 此外 , ICPs與 effective T-cell signature(CX3CR1、FGFBP2和FCGR3A)之間也存在顯著的相關性(R=0.87、P<0.01)(Fig.8D) , TIME因子和 effective T-cell signature(R=0.80 , P<0.01) (Fig.8E) , 以及ICD介質和 effective T-cell signature(R=0.88 , P<0.01) (Fig.8F) 。

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Fig.8
為了進一步證實ICD與TILs的相關性及其潛在的影響 , 選擇了8個具有代表性的ICD介質 , 并使用腫瘤和免疫系統相互作用數據庫(TISIDB)對多種癌癥類型進行了相關性分析 。 熱圖顯示 , 在大多數惡性腫瘤中 , TILs與多個具有代表性的ICD介質顯著相關 , 如CALR、LRP1 , ANXA1 , FPR1 , TLR3、IFNAR1 , PANX1 , 和P2RX7(Fig.9A-H) 。

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Fig.9
小編總結
本研究結合了TCGA和其他幾個開放的基因組數據庫來分析ICB治療的缺陷 。 強調了抗癌免疫治療中靶向TIME因子的潛在作用 , 并進一步討論了聯合靶向ICPs和TIME因子的組合策略 , 有利于腫瘤內T細胞浸潤 , 增強ICB療效,提出了將TIME因子的靶向作用納入抗癌藥物的意義 。
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