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NAR：新程序或能從700多種不同類型的癌細胞出識別出數千種癌癥“弱點”


當一個基因的狀態暴露了細胞對第二個基因擾動的脆弱性時 ， 比如化學抑制作用 ， 此時就會出現薄弱環節 ， 而該環節恰恰就成為了精準腫瘤學研究的切入點 ， 從而就能幫助開發治療多種癌癥的新型療法 。
日前 ， 一篇刊登在國際雜志Nucleic Acids Research上題為“SynLeGG：analysis and visualization of multiomics data for discovery of cancer 'Achilles Heels' and gene function relationships”的研究報告中 ， 來自皇后大學等機構的科學家們通過對700多種不同類型的癌細胞進行分析識別出了數千種癌癥的弱點 ， 這或有望成為癌癥研究史上的一大壯舉 。

NAR：新程序或能從700多種不同類型的癌細胞出識別出數千種癌癥“弱點”
本文插圖
圖片來源：https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab338/6275664

【NAR：新程序或能從700多種不同類型的癌細胞出識別出數千種癌癥“弱點”】未來 ， 研究人員或有望幫助開發新方法來通過利用當前藥物阻斷癌細胞的增殖和擴散 ， 同時還能為新型藥物開發提供新型靶點 。 而且這些藥物甚至還能用來對抗對當前標準化療法耐受的多種癌癥 。 文章中 ， 研究人員開發了一種名為MultiSEp的計算機程序 ， 其能幫助分析大規模復雜的數據集 。
研究者Ian Overton博士說道 ， 理解癌癥的分子指紋或能幫助開發新方法來找出最能精準化有效治療患者的藥物；而本文研究工作向更有效且個性化的癌癥治療邁出了一步 ， 最終或能挽救多種癌癥患者的生命 。 研究人員在SynLeGG服務器（利用遺傳和基因組學合成致死率 ， Synthetic Lethality with Genetics and Genomics）上公布了他們的研究成果 ， 這或為整個科學界的研究人員分享這些豐富的資源打開了一扇門 ， 從而有望加速全球癌癥研究進展 。
NAR：新程序或能從700多種不同類型的癌細胞出識別出數千種癌癥“弱點”
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SynLeGG的概況 。
圖片來源：Mark Wappett, et al. Nucleic Acids Research (2021). DOI:10.1093/nar/gkab338
癌癥通常由很多突變 ， 這些突變會誘發遺傳弱點或薄弱環節的出現 ， 比如癌癥通常會通過突變阻斷某些保護性基因（腫瘤抑制子）發揮功能來變得更加危險 ， 這也會使腫瘤依賴于一種備用基因 。 因此 ， 利用“化學敲擊錘”來打擊備用基因或有望殺滅癌細胞 。 MultiSEp程序或能幫助研究人員在700多種不同類型癌細胞中識別出數千種備用基因 ， 從而就能為設計更多有效抵御癌癥的有效療法提供相關的信息 。
研究者Simon McDade博士說道 ， 本文研究或未全球科學家們提供了寶貴的資源來從功能性基因組學篩選中提取寶貴的數據 ， 而從長遠來看 ， 這有可能轉化為為癌癥患者提供較大的利益 ， 而且來自全球的科學家們也能輕松有效地分析相關的遺傳數據 。 綜上 ， 本文研究為更多研究人員及社區提供了由尖端技術所產生的關鍵數據集 ， 以及分析這些數據的工具箱；研究人員希望后期能通過增加這些數據的覆蓋面 ， 來加快更有針對性及有效的抗癌療法的開發 。
原始出處：
Mark Wappett, Adam Harris, Alexander L R Lubbock, et al. SynLeGG: analysis and visualization of multiomics data for discovery of cancer 'Achilles Heels' and gene function relationships, Nucleic Acids Research (2021). DOI: 10.1093/nar/gkab338

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